Žitavany ležia asi 2 km severovýchodne od Zlatých Moraviec v údolí rieky Žitavy, na rozmedzí južných svahov Pohronského Inovca a severnej časti Podunajskej pahorkatiny, presnejšie Žitavskej pahorkatiny.
Z troch strán sú obkolesené svahmi pohorí Tríbeč a Pohronský Inovec, ktoré vytvárajú podkovu otvorenú juhozápadným smerom. Časť obce leží v severnej časti úrodnej Žitavskej nivy, druhá časť na terase Žitavy vytvorenej v dávnych dobách.